انصاریان در سال ۷۷ به پرسپولیس پیوست و برای پنج فصل پیاپی به عنوان یکی از بازیکنان محبوب پرسپولیس به شمار میرفت.
شماره ۸ اسبق قرمزها در نخستین دوره حضور در پرسپولیس در ۸۸ بازی که برای این باشگاه به میدان رفت ۱۰ گل برای این تیم به ثمر رساند که این آماری بسیار خوب برای یک مدافع میانی به حساب میآمد. انصاریان در پی اختلاف با کادر فنی پرسپولیس باعث شد تا برای یک نیم فصل از این تیم جدا شده و به سایپا بپیوندد.
علی انصاریان در سایپا شش بازی را انجام داد، اما در نهایت با مساعد شدن شرایط کادر فنی پرسپولیس به تیم محبوب خودش بازگشت و این بار برای دو فصل در این تیم بازی کرد و در ۴۸ بازی ۱۱ گل به ثمر رساند.
با اینکه انتظار میرفت علی انصاریان با همه ی مشکلات به خاطر هواداران در پرسپولیس باقی بماند، اما وی با عقد قراردادی یک ساله به تیم استقلال پیوست.
علی انصاریان در استقلال یکی از بازیکنان اصلی استقلال بود و در مجموع در ۲۳ دیدار برای این تیم بازی کرد و چهار گل را هم به ثمر رساند.
انصاریان در سال ۱۳۹۱ در برنامه ویتامین سه علی ضیا اعلام کرد، بزرگترین اشتباه زندگی ام بازی در استقلال بود اما شرایطی به وجود آمد که مجبور به این کار شدم.